微生物会带来严峻的腐蚀效果，不但会大大地缩短各种设备的运用寿命，并且会形成物料的跑、冒、滴、漏，污染环境，甚至被逼罢工停产。微生物的腐蚀性对于防腐设备同样有效，因此防腐设备的材料正在发生着改变。
防腐设备的材料改变这是一般首要思考的挑选计划，因为这是简单的一次性解决问题的办法，但是用一种更昂贵的材料来替代原受微生物腐蚀的材料，常常是错误的。不是所有昂贵的材料就是好的材料。
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如用不锈钢替代钢，但不锈钢是受微生物诱导腐蚀最严峻的材料。铜合金和铜-镍合金耐海水结污，但对srb的腐蚀是灵敏的，只要钛和更简便的材料才能耐加荣氏菌所生成的三价氯化铁及氯化锰介质的腐蚀。
因此在不更换设备的情况下，可以选择用花费少的防护涂料来维护防腐设备。方法比较简单，但是防护涂层会有漏涂的可能性，而漏涂点会引起细菌菌落在上面并繁殖。另外就是选用厚涂层或厚面料，但是必须经过试验证明，这种材料不被细菌腐蚀，并且也不是细菌的营养物质才行。
